Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Sin3aQ60520 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Sin3aQ60520 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sin3aQ60520 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sin3aQ60520 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sin3aQ60520 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Sin3aQ60520 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Sin3aQ60520 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Sin3aQ60520 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Sin3aQ60520 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Sin3aQ60520 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Sin3aQ60520 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Sin3aQ60520 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Sin3aQ60520 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sin3aQ60520 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sin3aQ60520 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sin3aQ60520 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sin3aQ60520 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sin3aQ60520 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sin3aQ60520 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sin3aQ60520 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sin3aQ60520 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sin3aQ60520 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
Sin3aQ60520 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sin3aQ60520 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sin3aQ60520 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sin3aQ60520 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sin3aQ60520 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sin3aQ60520 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sin3aQ60520 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Sin3aQ60520 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sin3aQ60520 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sin3aQ60520 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Sin3aQ60520 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sin3aQ60520 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sin3aQ60520 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sin3aQ60520 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sin3aQ60520 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sin3aQ60520 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sin3aQ60520 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sin3aQ60520 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Sin3aQ60520 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Sin3aQ60520 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Sin3aQ60520 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Sin3aQ60520 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Sin3aQ60520 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Sin3aQ60520 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sin3aQ60520 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sin3aQ60520 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Sin3aQ60520 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sin3aQ60520 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Sin3aQ60520 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sin3aQ60520 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sin3aQ60520 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Sin3aQ60520 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Sin3aQ60520 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Sin3aQ60520 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Sin3aQ60520 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Sin3aQ60520 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sin3aQ60520 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Sin3aQ60520 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sin3aQ60520 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sin3aQ60520 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Sin3aQ60520 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sin3aQ60520 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sin3aQ60520 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sin3aQ60520 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sin3aQ60520 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sin3aQ60520 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Sin3aQ60520 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Sin3aQ60520 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Sin3aQ60520 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Sin3aQ60520 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Sin3aQ60520 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Sin3aQ60520 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Sin3aQ60520 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Sin3aQ60520 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Sin3aQ60520 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Sin3aQ60520 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Sin3aQ60520 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Sin3aQ60520 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Sin3aQ60520 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Sin3aQ60520 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Sin3aQ60520 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Sin3aQ60520 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Sin3aQ60520 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Sin3aQ60520 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Sin3aQ60520 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Sin3aQ60520 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Sin3aQ60520 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Sin3aQ60520 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Sin3aQ60520 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Sin3aQ60520 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Sin3aQ60520 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Sin3aQ60520 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Sin3aQ60520 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Sin3aQ60520 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Sin3aQ60520 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Sin3aQ60520 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Sin3aQ60520 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms