Protein–RNA interactions for Protein: Q5U419

Mfsd3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd3Q5U419 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mfsd3Q5U419 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mfsd3Q5U419 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mfsd3Q5U419 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mfsd3Q5U419 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mfsd3Q5U419 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mfsd3Q5U419 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mfsd3Q5U419 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mfsd3Q5U419 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mfsd3Q5U419 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mfsd3Q5U419 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Mfsd3Q5U419 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Mfsd3Q5U419 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mfsd3Q5U419 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mfsd3Q5U419 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mfsd3Q5U419 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mfsd3Q5U419 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mfsd3Q5U419 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mfsd3Q5U419 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mfsd3Q5U419 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mfsd3Q5U419 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mfsd3Q5U419 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mfsd3Q5U419 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mfsd3Q5U419 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mfsd3Q5U419 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mfsd3Q5U419 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms