Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabl6Q5U3K5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabl6Q5U3K5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabl6Q5U3K5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabl6Q5U3K5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabl6Q5U3K5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabl6Q5U3K5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabl6Q5U3K5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabl6Q5U3K5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabl6Q5U3K5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabl6Q5U3K5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabl6Q5U3K5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rabl6Q5U3K5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabl6Q5U3K5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabl6Q5U3K5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabl6Q5U3K5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rabl6Q5U3K5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabl6Q5U3K5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabl6Q5U3K5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabl6Q5U3K5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabl6Q5U3K5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rabl6Q5U3K5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rabl6Q5U3K5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabl6Q5U3K5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabl6Q5U3K5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabl6Q5U3K5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabl6Q5U3K5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rabl6Q5U3K5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabl6Q5U3K5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabl6Q5U3K5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabl6Q5U3K5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabl6Q5U3K5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabl6Q5U3K5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rabl6Q5U3K5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rabl6Q5U3K5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabl6Q5U3K5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rabl6Q5U3K5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabl6Q5U3K5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rabl6Q5U3K5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rabl6Q5U3K5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rabl6Q5U3K5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabl6Q5U3K5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabl6Q5U3K5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabl6Q5U3K5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabl6Q5U3K5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rabl6Q5U3K5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabl6Q5U3K5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabl6Q5U3K5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabl6Q5U3K5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rabl6Q5U3K5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabl6Q5U3K5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabl6Q5U3K5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabl6Q5U3K5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rabl6Q5U3K5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms