Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim38Q5SZ99 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim38Q5SZ99 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim38Q5SZ99 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim38Q5SZ99 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim38Q5SZ99 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim38Q5SZ99 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim38Q5SZ99 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim38Q5SZ99 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim38Q5SZ99 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim38Q5SZ99 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim38Q5SZ99 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim38Q5SZ99 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim38Q5SZ99 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim38Q5SZ99 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim38Q5SZ99 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim38Q5SZ99 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim38Q5SZ99 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim38Q5SZ99 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim38Q5SZ99 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim38Q5SZ99 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim38Q5SZ99 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim38Q5SZ99 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim38Q5SZ99 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim38Q5SZ99 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim38Q5SZ99 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim38Q5SZ99 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim38Q5SZ99 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim38Q5SZ99 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim38Q5SZ99 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim38Q5SZ99 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim38Q5SZ99 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim38Q5SZ99 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
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