Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Scarf1Q5ND28 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scarf1Q5ND28 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Scarf1Q5ND28 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scarf1Q5ND28 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scarf1Q5ND28 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scarf1Q5ND28 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scarf1Q5ND28 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scarf1Q5ND28 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scarf1Q5ND28 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms