Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fbxo39Q5NBU5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo39Q5NBU5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo39Q5NBU5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo39Q5NBU5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo39Q5NBU5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo39Q5NBU5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo39Q5NBU5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo39Q5NBU5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo39Q5NBU5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo39Q5NBU5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo39Q5NBU5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo39Q5NBU5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo39Q5NBU5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo39Q5NBU5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo39Q5NBU5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo39Q5NBU5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo39Q5NBU5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo39Q5NBU5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo39Q5NBU5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo39Q5NBU5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo39Q5NBU5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo39Q5NBU5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo39Q5NBU5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Fbxo39Q5NBU5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo39Q5NBU5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms