Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJS3

Fam20c, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20cQ5MJS3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam20cQ5MJS3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam20cQ5MJS3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam20cQ5MJS3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam20cQ5MJS3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam20cQ5MJS3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam20cQ5MJS3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam20cQ5MJS3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam20cQ5MJS3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam20cQ5MJS3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam20cQ5MJS3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam20cQ5MJS3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam20cQ5MJS3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam20cQ5MJS3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam20cQ5MJS3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam20cQ5MJS3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam20cQ5MJS3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam20cQ5MJS3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam20cQ5MJS3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam20cQ5MJS3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam20cQ5MJS3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam20cQ5MJS3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam20cQ5MJS3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms