Protein–RNA interactions for Protein: Q5ISE2

Zfp36l3, mRNA decay activator protein ZFP36L3, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36l3Q5ISE2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp36l3Q5ISE2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp36l3Q5ISE2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp36l3Q5ISE2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp36l3Q5ISE2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp36l3Q5ISE2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp36l3Q5ISE2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp36l3Q5ISE2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp36l3Q5ISE2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp36l3Q5ISE2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp36l3Q5ISE2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp36l3Q5ISE2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp36l3Q5ISE2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp36l3Q5ISE2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp36l3Q5ISE2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zfp36l3Q5ISE2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp36l3Q5ISE2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zfp36l3Q5ISE2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp36l3Q5ISE2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp36l3Q5ISE2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp36l3Q5ISE2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp36l3Q5ISE2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp36l3Q5ISE2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp36l3Q5ISE2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp36l3Q5ISE2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp36l3Q5ISE2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp36l3Q5ISE2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms