Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trappc3lQ4KL14 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trappc3lQ4KL14 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trappc3lQ4KL14 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Trappc3lQ4KL14 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Trappc3lQ4KL14 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trappc3lQ4KL14 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trappc3lQ4KL14 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trappc3lQ4KL14 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trappc3lQ4KL14 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trappc3lQ4KL14 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trappc3lQ4KL14 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc3lQ4KL14 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc3lQ4KL14 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc3lQ4KL14 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc3lQ4KL14 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Trappc3lQ4KL14 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trappc3lQ4KL14 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trappc3lQ4KL14 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trappc3lQ4KL14 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trappc3lQ4KL14 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trappc3lQ4KL14 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trappc3lQ4KL14 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trappc3lQ4KL14 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trappc3lQ4KL14 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Trappc3lQ4KL14 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc3lQ4KL14 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc3lQ4KL14 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc3lQ4KL14 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc3lQ4KL14 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trappc3lQ4KL14 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc3lQ4KL14 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc3lQ4KL14 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trappc3lQ4KL14 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trappc3lQ4KL14 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trappc3lQ4KL14 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trappc3lQ4KL14 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc3lQ4KL14 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc3lQ4KL14 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc3lQ4KL14 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trappc3lQ4KL14 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trappc3lQ4KL14 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trappc3lQ4KL14 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trappc3lQ4KL14 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trappc3lQ4KL14 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trappc3lQ4KL14 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trappc3lQ4KL14 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trappc3lQ4KL14 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc3lQ4KL14 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc3lQ4KL14 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc3lQ4KL14 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trappc3lQ4KL14 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trappc3lQ4KL14 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trappc3lQ4KL14 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trappc3lQ4KL14 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc3lQ4KL14 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc3lQ4KL14 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc3lQ4KL14 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc3lQ4KL14 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Trappc3lQ4KL14 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc3lQ4KL14 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc3lQ4KL14 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc3lQ4KL14 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trappc3lQ4KL14 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc3lQ4KL14 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc3lQ4KL14 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc3lQ4KL14 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc3lQ4KL14 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trappc3lQ4KL14 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trappc3lQ4KL14 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trappc3lQ4KL14 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trappc3lQ4KL14 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trappc3lQ4KL14 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trappc3lQ4KL14 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trappc3lQ4KL14 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trappc3lQ4KL14 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc3lQ4KL14 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trappc3lQ4KL14 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms