Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2C1

Krtap9-3, Keratin-associated protein 9-3, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap9-3Q3V2C1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap9-3Q3V2C1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap9-3Q3V2C1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap9-3Q3V2C1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap9-3Q3V2C1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap9-3Q3V2C1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap9-3Q3V2C1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap9-3Q3V2C1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap9-3Q3V2C1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap9-3Q3V2C1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap9-3Q3V2C1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap9-3Q3V2C1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap9-3Q3V2C1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap9-3Q3V2C1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap9-3Q3V2C1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap9-3Q3V2C1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap9-3Q3V2C1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Krtap9-3Q3V2C1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Krtap9-3Q3V2C1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Krtap9-3Q3V2C1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap9-3Q3V2C1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap9-3Q3V2C1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap9-3Q3V2C1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap9-3Q3V2C1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap9-3Q3V2C1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap9-3Q3V2C1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap9-3Q3V2C1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap9-3Q3V2C1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap9-3Q3V2C1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap9-3Q3V2C1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap9-3Q3V2C1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap9-3Q3V2C1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap9-3Q3V2C1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Krtap9-3Q3V2C1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap9-3Q3V2C1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap9-3Q3V2C1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Krtap9-3Q3V2C1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms