Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bbof1Q3V079 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bbof1Q3V079 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bbof1Q3V079 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bbof1Q3V079 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bbof1Q3V079 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bbof1Q3V079 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bbof1Q3V079 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bbof1Q3V079 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bbof1Q3V079 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Bbof1Q3V079 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bbof1Q3V079 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bbof1Q3V079 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bbof1Q3V079 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bbof1Q3V079 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Bbof1Q3V079 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bbof1Q3V079 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bbof1Q3V079 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bbof1Q3V079 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bbof1Q3V079 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bbof1Q3V079 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bbof1Q3V079 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bbof1Q3V079 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bbof1Q3V079 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bbof1Q3V079 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bbof1Q3V079 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bbof1Q3V079 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bbof1Q3V079 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bbof1Q3V079 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bbof1Q3V079 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bbof1Q3V079 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bbof1Q3V079 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bbof1Q3V079 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Bbof1Q3V079 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bbof1Q3V079 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bbof1Q3V079 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bbof1Q3V079 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bbof1Q3V079 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bbof1Q3V079 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bbof1Q3V079 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Bbof1Q3V079 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bbof1Q3V079 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bbof1Q3V079 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Bbof1Q3V079 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Bbof1Q3V079 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bbof1Q3V079 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bbof1Q3V079 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bbof1Q3V079 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bbof1Q3V079 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bbof1Q3V079 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bbof1Q3V079 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Bbof1Q3V079 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bbof1Q3V079 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bbof1Q3V079 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bbof1Q3V079 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bbof1Q3V079 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bbof1Q3V079 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bbof1Q3V079 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Bbof1Q3V079 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Bbof1Q3V079 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bbof1Q3V079 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bbof1Q3V079 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Bbof1Q3V079 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bbof1Q3V079 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bbof1Q3V079 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bbof1Q3V079 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bbof1Q3V079 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bbof1Q3V079 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms