Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim80Q3V061 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim80Q3V061 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim80Q3V061 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim80Q3V061 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim80Q3V061 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms