Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hipk4Q3V016 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hipk4Q3V016 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hipk4Q3V016 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hipk4Q3V016 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hipk4Q3V016 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hipk4Q3V016 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hipk4Q3V016 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hipk4Q3V016 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hipk4Q3V016 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hipk4Q3V016 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hipk4Q3V016 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hipk4Q3V016 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hipk4Q3V016 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hipk4Q3V016 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hipk4Q3V016 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hipk4Q3V016 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hipk4Q3V016 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hipk4Q3V016 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hipk4Q3V016 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hipk4Q3V016 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hipk4Q3V016 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hipk4Q3V016 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hipk4Q3V016 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hipk4Q3V016 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hipk4Q3V016 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hipk4Q3V016 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hipk4Q3V016 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hipk4Q3V016 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hipk4Q3V016 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hipk4Q3V016 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hipk4Q3V016 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hipk4Q3V016 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hipk4Q3V016 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hipk4Q3V016 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hipk4Q3V016 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hipk4Q3V016 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hipk4Q3V016 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hipk4Q3V016 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms