Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZA1

Rcsd1, CapZ-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcsd1Q3UZA1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rcsd1Q3UZA1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rcsd1Q3UZA1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rcsd1Q3UZA1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rcsd1Q3UZA1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rcsd1Q3UZA1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rcsd1Q3UZA1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rcsd1Q3UZA1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rcsd1Q3UZA1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rcsd1Q3UZA1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rcsd1Q3UZA1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rcsd1Q3UZA1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rcsd1Q3UZA1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rcsd1Q3UZA1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rcsd1Q3UZA1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rcsd1Q3UZA1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rcsd1Q3UZA1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rcsd1Q3UZA1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rcsd1Q3UZA1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rcsd1Q3UZA1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rcsd1Q3UZA1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rcsd1Q3UZA1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rcsd1Q3UZA1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rcsd1Q3UZA1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rcsd1Q3UZA1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rcsd1Q3UZA1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rcsd1Q3UZA1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rcsd1Q3UZA1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rcsd1Q3UZA1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rcsd1Q3UZA1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rcsd1Q3UZA1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rcsd1Q3UZA1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rcsd1Q3UZA1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Rcsd1Q3UZA1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rcsd1Q3UZA1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rcsd1Q3UZA1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rcsd1Q3UZA1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rcsd1Q3UZA1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rcsd1Q3UZA1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rcsd1Q3UZA1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rcsd1Q3UZA1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rcsd1Q3UZA1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rcsd1Q3UZA1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rcsd1Q3UZA1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rcsd1Q3UZA1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rcsd1Q3UZA1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rcsd1Q3UZA1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rcsd1Q3UZA1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rcsd1Q3UZA1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rcsd1Q3UZA1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rcsd1Q3UZA1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rcsd1Q3UZA1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rcsd1Q3UZA1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rcsd1Q3UZA1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rcsd1Q3UZA1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rcsd1Q3UZA1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rcsd1Q3UZA1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rcsd1Q3UZA1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rcsd1Q3UZA1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rcsd1Q3UZA1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rcsd1Q3UZA1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rcsd1Q3UZA1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rcsd1Q3UZA1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rcsd1Q3UZA1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rcsd1Q3UZA1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rcsd1Q3UZA1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rcsd1Q3UZA1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rcsd1Q3UZA1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rcsd1Q3UZA1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rcsd1Q3UZA1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rcsd1Q3UZA1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rcsd1Q3UZA1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rcsd1Q3UZA1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rcsd1Q3UZA1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rcsd1Q3UZA1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rcsd1Q3UZA1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rcsd1Q3UZA1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms