Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E330034G19RikQ3UWX6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E330034G19RikQ3UWX6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E330034G19RikQ3UWX6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
E330034G19RikQ3UWX6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E330034G19RikQ3UWX6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E330034G19RikQ3UWX6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E330034G19RikQ3UWX6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E330034G19RikQ3UWX6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E330034G19RikQ3UWX6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E330034G19RikQ3UWX6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E330034G19RikQ3UWX6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E330034G19RikQ3UWX6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
E330034G19RikQ3UWX6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E330034G19RikQ3UWX6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E330034G19RikQ3UWX6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E330034G19RikQ3UWX6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E330034G19RikQ3UWX6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms