Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capn13Q3UW68 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capn13Q3UW68 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn13Q3UW68 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn13Q3UW68 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn13Q3UW68 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn13Q3UW68 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn13Q3UW68 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn13Q3UW68 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capn13Q3UW68 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Capn13Q3UW68 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Capn13Q3UW68 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Capn13Q3UW68 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Capn13Q3UW68 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capn13Q3UW68 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capn13Q3UW68 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capn13Q3UW68 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capn13Q3UW68 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capn13Q3UW68 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capn13Q3UW68 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Capn13Q3UW68 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Capn13Q3UW68 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capn13Q3UW68 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capn13Q3UW68 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Capn13Q3UW68 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms