Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW5

Foxred2, FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxred2Q3USW5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxred2Q3USW5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Foxred2Q3USW5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxred2Q3USW5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxred2Q3USW5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxred2Q3USW5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxred2Q3USW5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxred2Q3USW5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxred2Q3USW5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxred2Q3USW5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxred2Q3USW5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxred2Q3USW5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxred2Q3USW5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxred2Q3USW5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxred2Q3USW5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxred2Q3USW5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxred2Q3USW5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxred2Q3USW5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxred2Q3USW5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxred2Q3USW5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxred2Q3USW5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxred2Q3USW5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Foxred2Q3USW5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Foxred2Q3USW5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxred2Q3USW5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxred2Q3USW5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxred2Q3USW5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxred2Q3USW5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxred2Q3USW5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxred2Q3USW5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxred2Q3USW5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms