Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm28047Q3US59 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm28047Q3US59 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm28047Q3US59 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm28047Q3US59 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm28047Q3US59 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm28047Q3US59 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm28047Q3US59 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm28047Q3US59 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm28047Q3US59 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm28047Q3US59 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm28047Q3US59 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Gm28047Q3US59 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm28047Q3US59 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm28047Q3US59 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm28047Q3US59 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm28047Q3US59 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm28047Q3US59 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm28047Q3US59 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm28047Q3US59 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm28047Q3US59 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm28047Q3US59 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm28047Q3US59 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm28047Q3US59 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm28047Q3US59 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm28047Q3US59 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm28047Q3US59 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm28047Q3US59 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm28047Q3US59 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm28047Q3US59 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm28047Q3US59 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm28047Q3US59 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm28047Q3US59 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm28047Q3US59 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm28047Q3US59 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm28047Q3US59 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gm28047Q3US59 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm28047Q3US59 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm28047Q3US59 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Gm28047Q3US59 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
Gm28047Q3US59 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Gm28047Q3US59 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gm28047Q3US59 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms