Protein–RNA interactions for Protein: Q3URD2

Rprml, Reprimo-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmlQ3URD2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RprmlQ3URD2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RprmlQ3URD2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RprmlQ3URD2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RprmlQ3URD2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RprmlQ3URD2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RprmlQ3URD2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RprmlQ3URD2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RprmlQ3URD2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RprmlQ3URD2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RprmlQ3URD2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RprmlQ3URD2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RprmlQ3URD2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RprmlQ3URD2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RprmlQ3URD2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RprmlQ3URD2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms