Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q3UPC7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Q3UPC7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Q3UPC7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Q3UPC7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Q3UPC7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Q3UPC7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Q3UPC7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Q3UPC7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Q3UPC7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Q3UPC7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Q3UPC7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q3UPC7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q3UPC7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q3UPC7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q3UPC7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q3UPC7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Q3UPC7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Q3UPC7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Q3UPC7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Q3UPC7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q3UPC7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q3UPC7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q3UPC7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Q3UPC7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q3UPC7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q3UPC7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Q3UPC7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q3UPC7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Q3UPC7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Q3UPC7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Q3UPC7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Q3UPC7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Q3UPC7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Q3UPC7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Q3UPC7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Q3UPC7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Q3UPC7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Q3UPC7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Q3UPC7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Q3UPC7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Q3UPC7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q3UPC7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q3UPC7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q3UPC7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q3UPC7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q3UPC7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q3UPC7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Q3UPC7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Q3UPC7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Q3UPC7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Q3UPC7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Q3UPC7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Q3UPC7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Q3UPC7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Q3UPC7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Q3UPC7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Q3UPC7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Q3UPC7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Q3UPC7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Q3UPC7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Q3UPC7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Q3UPC7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Q3UPC7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Q3UPC7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Q3UPC7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Q3UPC7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Q3UPC7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Q3UPC7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Q3UPC7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Q3UPC7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Q3UPC7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Q3UPC7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Q3UPC7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Q3UPC7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Q3UPC7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Q3UPC7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Q3UPC7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Q3UPC7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Q3UPC7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Q3UPC7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Q3UPC7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Q3UPC7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Q3UPC7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Q3UPC7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Q3UPC7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Q3UPC7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Q3UPC7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Q3UPC7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Q3UPC7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Q3UPC7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Q3UPC7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Q3UPC7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Q3UPC7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Q3UPC7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Q3UPC7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Q3UPC7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Q3UPC7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Q3UPC7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Q3UPC7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms