Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrc4Q3UP24 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrc4Q3UP24 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrc4Q3UP24 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrc4Q3UP24 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrc4Q3UP24 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrc4Q3UP24 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrc4Q3UP24 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nlrc4Q3UP24 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrc4Q3UP24 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrc4Q3UP24 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrc4Q3UP24 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrc4Q3UP24 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrc4Q3UP24 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrc4Q3UP24 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrc4Q3UP24 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrc4Q3UP24 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrc4Q3UP24 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrc4Q3UP24 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrc4Q3UP24 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrc4Q3UP24 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nlrc4Q3UP24 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrc4Q3UP24 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms