Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrch2Q3UMG5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrch2Q3UMG5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lrch2Q3UMG5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrch2Q3UMG5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrch2Q3UMG5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms