Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJK4

Gtpbp2, GTP-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp2Q3UJK4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtpbp2Q3UJK4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtpbp2Q3UJK4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtpbp2Q3UJK4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtpbp2Q3UJK4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtpbp2Q3UJK4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms