Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Edc4Q3UJB9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Edc4Q3UJB9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Edc4Q3UJB9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Edc4Q3UJB9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Edc4Q3UJB9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Edc4Q3UJB9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Edc4Q3UJB9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Edc4Q3UJB9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Edc4Q3UJB9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Edc4Q3UJB9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Edc4Q3UJB9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Edc4Q3UJB9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Edc4Q3UJB9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Edc4Q3UJB9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Edc4Q3UJB9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Edc4Q3UJB9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Edc4Q3UJB9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Edc4Q3UJB9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Edc4Q3UJB9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Edc4Q3UJB9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Edc4Q3UJB9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Edc4Q3UJB9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Edc4Q3UJB9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Edc4Q3UJB9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Edc4Q3UJB9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Edc4Q3UJB9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Edc4Q3UJB9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Edc4Q3UJB9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Edc4Q3UJB9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Edc4Q3UJB9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Edc4Q3UJB9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Edc4Q3UJB9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Edc4Q3UJB9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Edc4Q3UJB9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Edc4Q3UJB9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Edc4Q3UJB9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Edc4Q3UJB9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Edc4Q3UJB9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Edc4Q3UJB9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Edc4Q3UJB9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Edc4Q3UJB9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Edc4Q3UJB9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Edc4Q3UJB9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Edc4Q3UJB9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Edc4Q3UJB9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Edc4Q3UJB9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Edc4Q3UJB9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Edc4Q3UJB9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Edc4Q3UJB9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Edc4Q3UJB9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Edc4Q3UJB9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Edc4Q3UJB9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Edc4Q3UJB9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Edc4Q3UJB9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Edc4Q3UJB9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Edc4Q3UJB9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Edc4Q3UJB9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Edc4Q3UJB9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Edc4Q3UJB9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Edc4Q3UJB9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Edc4Q3UJB9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Edc4Q3UJB9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Edc4Q3UJB9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Edc4Q3UJB9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Edc4Q3UJB9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Edc4Q3UJB9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Edc4Q3UJB9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Edc4Q3UJB9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Edc4Q3UJB9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Edc4Q3UJB9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Edc4Q3UJB9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Edc4Q3UJB9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Edc4Q3UJB9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Edc4Q3UJB9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Edc4Q3UJB9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Edc4Q3UJB9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Edc4Q3UJB9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms