Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccser2Q3UHI0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccser2Q3UHI0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccser2Q3UHI0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccser2Q3UHI0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms