Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHA3

Spg11, Spatacsin, mousemouse

Predictions only

Length 2,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg11Q3UHA3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spg11Q3UHA3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spg11Q3UHA3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Spg11Q3UHA3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Spg11Q3UHA3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spg11Q3UHA3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spg11Q3UHA3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg11Q3UHA3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spg11Q3UHA3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg11Q3UHA3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg11Q3UHA3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg11Q3UHA3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spg11Q3UHA3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spg11Q3UHA3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Spg11Q3UHA3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spg11Q3UHA3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spg11Q3UHA3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spg11Q3UHA3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Spg11Q3UHA3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Spg11Q3UHA3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spg11Q3UHA3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Spg11Q3UHA3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Spg11Q3UHA3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Spg11Q3UHA3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spg11Q3UHA3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spg11Q3UHA3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Spg11Q3UHA3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Spg11Q3UHA3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spg11Q3UHA3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spg11Q3UHA3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spg11Q3UHA3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Spg11Q3UHA3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Spg11Q3UHA3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spg11Q3UHA3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spg11Q3UHA3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Spg11Q3UHA3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spg11Q3UHA3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spg11Q3UHA3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spg11Q3UHA3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spg11Q3UHA3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spg11Q3UHA3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spg11Q3UHA3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spg11Q3UHA3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spg11Q3UHA3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spg11Q3UHA3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spg11Q3UHA3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spg11Q3UHA3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spg11Q3UHA3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spg11Q3UHA3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spg11Q3UHA3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spg11Q3UHA3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spg11Q3UHA3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spg11Q3UHA3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Spg11Q3UHA3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms