Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rrp36Q3UFY0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrp36Q3UFY0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rrp36Q3UFY0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rrp36Q3UFY0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms