Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmd8Q3UFK8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Frmd8Q3UFK8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Frmd8Q3UFK8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frmd8Q3UFK8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frmd8Q3UFK8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frmd8Q3UFK8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Frmd8Q3UFK8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Frmd8Q3UFK8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Frmd8Q3UFK8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frmd8Q3UFK8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frmd8Q3UFK8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frmd8Q3UFK8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frmd8Q3UFK8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frmd8Q3UFK8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frmd8Q3UFK8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmd8Q3UFK8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmd8Q3UFK8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frmd8Q3UFK8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmd8Q3UFK8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmd8Q3UFK8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frmd8Q3UFK8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frmd8Q3UFK8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Frmd8Q3UFK8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Frmd8Q3UFK8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frmd8Q3UFK8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Frmd8Q3UFK8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmd8Q3UFK8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmd8Q3UFK8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Frmd8Q3UFK8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmd8Q3UFK8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Frmd8Q3UFK8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frmd8Q3UFK8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frmd8Q3UFK8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frmd8Q3UFK8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Frmd8Q3UFK8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmd8Q3UFK8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmd8Q3UFK8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmd8Q3UFK8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmd8Q3UFK8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Frmd8Q3UFK8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmd8Q3UFK8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmd8Q3UFK8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmd8Q3UFK8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmd8Q3UFK8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmd8Q3UFK8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmd8Q3UFK8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Frmd8Q3UFK8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms