Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr41Q3UDP0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr41Q3UDP0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr41Q3UDP0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr41Q3UDP0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr41Q3UDP0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr41Q3UDP0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr41Q3UDP0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Wdr41Q3UDP0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Wdr41Q3UDP0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Wdr41Q3UDP0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr41Q3UDP0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr41Q3UDP0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr41Q3UDP0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr41Q3UDP0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr41Q3UDP0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr41Q3UDP0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr41Q3UDP0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr41Q3UDP0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr41Q3UDP0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr41Q3UDP0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr41Q3UDP0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Wdr41Q3UDP0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Wdr41Q3UDP0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Wdr41Q3UDP0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Wdr41Q3UDP0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Wdr41Q3UDP0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Wdr41Q3UDP0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Wdr41Q3UDP0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Wdr41Q3UDP0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Wdr41Q3UDP0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Wdr41Q3UDP0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Wdr41Q3UDP0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Wdr41Q3UDP0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Wdr41Q3UDP0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Wdr41Q3UDP0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Wdr41Q3UDP0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Wdr41Q3UDP0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Wdr41Q3UDP0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Wdr41Q3UDP0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Wdr41Q3UDP0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Wdr41Q3UDP0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr41Q3UDP0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr41Q3UDP0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr41Q3UDP0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr41Q3UDP0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms