Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VwceQ3U515 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VwceQ3U515 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VwceQ3U515 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VwceQ3U515 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VwceQ3U515 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VwceQ3U515 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VwceQ3U515 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VwceQ3U515 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VwceQ3U515 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VwceQ3U515 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VwceQ3U515 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VwceQ3U515 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VwceQ3U515 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VwceQ3U515 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VwceQ3U515 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VwceQ3U515 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VwceQ3U515 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VwceQ3U515 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VwceQ3U515 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VwceQ3U515 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VwceQ3U515 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VwceQ3U515 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VwceQ3U515 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VwceQ3U515 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VwceQ3U515 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VwceQ3U515 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VwceQ3U515 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VwceQ3U515 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VwceQ3U515 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VwceQ3U515 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VwceQ3U515 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VwceQ3U515 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VwceQ3U515 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VwceQ3U515 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VwceQ3U515 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms