Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Rnf149Q3U2C5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf149Q3U2C5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Rnf149Q3U2C5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf149Q3U2C5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Rnf149Q3U2C5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Rnf149Q3U2C5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf149Q3U2C5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf149Q3U2C5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf149Q3U2C5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf149Q3U2C5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf149Q3U2C5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf149Q3U2C5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf149Q3U2C5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf149Q3U2C5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf149Q3U2C5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf149Q3U2C5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf149Q3U2C5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf149Q3U2C5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Rnf149Q3U2C5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf149Q3U2C5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf149Q3U2C5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf149Q3U2C5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf149Q3U2C5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf149Q3U2C5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf149Q3U2C5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf149Q3U2C5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf149Q3U2C5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf149Q3U2C5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf149Q3U2C5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf149Q3U2C5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf149Q3U2C5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf149Q3U2C5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf149Q3U2C5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf149Q3U2C5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf149Q3U2C5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf149Q3U2C5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf149Q3U2C5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf149Q3U2C5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf149Q3U2C5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf149Q3U2C5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf149Q3U2C5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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