Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Q3TTL0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3TTL0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3TTL0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3TTL0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3TTL0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3TTL0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3TTL0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3TTL0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3TTL0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3TTL0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3TTL0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3TTL0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3TTL0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3TTL0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3TTL0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3TTL0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3TTL0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3TTL0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3TTL0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3TTL0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3TTL0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3TTL0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3TTL0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3TTL0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3TTL0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3TTL0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3TTL0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3TTL0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3TTL0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q3TTL0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3TTL0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3TTL0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q3TTL0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3TTL0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q3TTL0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3TTL0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q3TTL0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q3TTL0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3TTL0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q3TTL0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3TTL0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q3TTL0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3TTL0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3TTL0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3TTL0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q3TTL0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TTL0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TTL0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TTL0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TTL0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q3TTL0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3TTL0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3TTL0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q3TTL0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3TTL0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3TTL0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3TTL0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q3TTL0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3TTL0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q3TTL0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q3TTL0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q3TTL0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms