Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTH7

1500011B03Rik, RIKEN cDNA 1500011B03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500011B03RikQ3TTH7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1500011B03RikQ3TTH7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1500011B03RikQ3TTH7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1500011B03RikQ3TTH7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1500011B03RikQ3TTH7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms