Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gdpd4Q3TT99 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gdpd4Q3TT99 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gdpd4Q3TT99 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gdpd4Q3TT99 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms