Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gtf3c3Q3TMP1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gtf3c3Q3TMP1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gtf3c3Q3TMP1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtf3c3Q3TMP1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtf3c3Q3TMP1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gtf3c3Q3TMP1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gtf3c3Q3TMP1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf3c3Q3TMP1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf3c3Q3TMP1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gtf3c3Q3TMP1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gtf3c3Q3TMP1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gtf3c3Q3TMP1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf3c3Q3TMP1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf3c3Q3TMP1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtf3c3Q3TMP1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf3c3Q3TMP1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf3c3Q3TMP1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf3c3Q3TMP1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtf3c3Q3TMP1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtf3c3Q3TMP1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtf3c3Q3TMP1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtf3c3Q3TMP1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gtf3c3Q3TMP1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gtf3c3Q3TMP1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf3c3Q3TMP1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf3c3Q3TMP1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtf3c3Q3TMP1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtf3c3Q3TMP1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtf3c3Q3TMP1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtf3c3Q3TMP1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtf3c3Q3TMP1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gtf3c3Q3TMP1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gtf3c3Q3TMP1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtf3c3Q3TMP1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms