Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdss1Q33DR2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdss1Q33DR2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdss1Q33DR2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdss1Q33DR2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdss1Q33DR2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdss1Q33DR2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdss1Q33DR2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdss1Q33DR2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdss1Q33DR2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdss1Q33DR2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdss1Q33DR2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdss1Q33DR2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdss1Q33DR2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdss1Q33DR2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdss1Q33DR2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdss1Q33DR2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdss1Q33DR2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdss1Q33DR2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdss1Q33DR2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdss1Q33DR2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdss1Q33DR2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdss1Q33DR2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdss1Q33DR2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pdss1Q33DR2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdss1Q33DR2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdss1Q33DR2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdss1Q33DR2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdss1Q33DR2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdss1Q33DR2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdss1Q33DR2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pdss1Q33DR2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pdss1Q33DR2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdss1Q33DR2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdss1Q33DR2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdss1Q33DR2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdss1Q33DR2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdss1Q33DR2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdss1Q33DR2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdss1Q33DR2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdss1Q33DR2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdss1Q33DR2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdss1Q33DR2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdss1Q33DR2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdss1Q33DR2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdss1Q33DR2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdss1Q33DR2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdss1Q33DR2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdss1Q33DR2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdss1Q33DR2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdss1Q33DR2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdss1Q33DR2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pdss1Q33DR2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pdss1Q33DR2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdss1Q33DR2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdss1Q33DR2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdss1Q33DR2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdss1Q33DR2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdss1Q33DR2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdss1Q33DR2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdss1Q33DR2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdss1Q33DR2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdss1Q33DR2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdss1Q33DR2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdss1Q33DR2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdss1Q33DR2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdss1Q33DR2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdss1Q33DR2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdss1Q33DR2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdss1Q33DR2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdss1Q33DR2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdss1Q33DR2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms