Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smim24Q0VG18 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smim24Q0VG18 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smim24Q0VG18 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smim24Q0VG18 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smim24Q0VG18 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smim24Q0VG18 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smim24Q0VG18 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smim24Q0VG18 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smim24Q0VG18 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smim24Q0VG18 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smim24Q0VG18 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smim24Q0VG18 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smim24Q0VG18 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Smim24Q0VG18 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smim24Q0VG18 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim24Q0VG18 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smim24Q0VG18 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim24Q0VG18 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms