Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttc39dQ0VF76 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttc39dQ0VF76 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc39dQ0VF76 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc39dQ0VF76 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc39dQ0VF76 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc39dQ0VF76 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc39dQ0VF76 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc39dQ0VF76 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc39dQ0VF76 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc39dQ0VF76 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc39dQ0VF76 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc39dQ0VF76 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc39dQ0VF76 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc39dQ0VF76 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc39dQ0VF76 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc39dQ0VF76 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc39dQ0VF76 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc39dQ0VF76 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc39dQ0VF76 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc39dQ0VF76 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms