Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rundc1Q0VDN7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rundc1Q0VDN7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rundc1Q0VDN7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rundc1Q0VDN7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rundc1Q0VDN7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rundc1Q0VDN7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rundc1Q0VDN7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Rundc1Q0VDN7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Rundc1Q0VDN7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rundc1Q0VDN7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rundc1Q0VDN7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rundc1Q0VDN7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rundc1Q0VDN7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Rundc1Q0VDN7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rundc1Q0VDN7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rundc1Q0VDN7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rundc1Q0VDN7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Rundc1Q0VDN7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rundc1Q0VDN7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rundc1Q0VDN7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rundc1Q0VDN7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rundc1Q0VDN7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rundc1Q0VDN7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rundc1Q0VDN7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rundc1Q0VDN7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rundc1Q0VDN7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rundc1Q0VDN7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rundc1Q0VDN7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rundc1Q0VDN7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rundc1Q0VDN7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Rundc1Q0VDN7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rundc1Q0VDN7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rundc1Q0VDN7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Rundc1Q0VDN7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rundc1Q0VDN7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rundc1Q0VDN7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Rundc1Q0VDN7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rundc1Q0VDN7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rundc1Q0VDN7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rundc1Q0VDN7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rundc1Q0VDN7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rundc1Q0VDN7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rundc1Q0VDN7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rundc1Q0VDN7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rundc1Q0VDN7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rundc1Q0VDN7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rundc1Q0VDN7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Rundc1Q0VDN7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rundc1Q0VDN7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rundc1Q0VDN7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rundc1Q0VDN7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rundc1Q0VDN7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rundc1Q0VDN7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rundc1Q0VDN7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rundc1Q0VDN7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rundc1Q0VDN7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rundc1Q0VDN7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rundc1Q0VDN7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rundc1Q0VDN7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Rundc1Q0VDN7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rundc1Q0VDN7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rundc1Q0VDN7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rundc1Q0VDN7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Rundc1Q0VDN7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rundc1Q0VDN7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rundc1Q0VDN7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rundc1Q0VDN7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rundc1Q0VDN7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rundc1Q0VDN7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rundc1Q0VDN7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rundc1Q0VDN7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rundc1Q0VDN7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rundc1Q0VDN7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rundc1Q0VDN7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rundc1Q0VDN7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rundc1Q0VDN7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms