Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
StumQ0VBF8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
StumQ0VBF8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
StumQ0VBF8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
StumQ0VBF8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
StumQ0VBF8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
StumQ0VBF8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
StumQ0VBF8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms