Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Lrriq1Q0P5X1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Lrriq1Q0P5X1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Lrriq1Q0P5X1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Lrriq1Q0P5X1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Lrriq1Q0P5X1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Lrriq1Q0P5X1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Lrriq1Q0P5X1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Lrriq1Q0P5X1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Lrriq1Q0P5X1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Lrriq1Q0P5X1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
Lrriq1Q0P5X1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Lrriq1Q0P5X1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Lrriq1Q0P5X1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Lrriq1Q0P5X1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
Lrriq1Q0P5X1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Lrriq1Q0P5X1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Lrriq1Q0P5X1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Lrriq1Q0P5X1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Lrriq1Q0P5X1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Lrriq1Q0P5X1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Lrriq1Q0P5X1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
Lrriq1Q0P5X1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Lrriq1Q0P5X1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Lrriq1Q0P5X1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Lrriq1Q0P5X1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Lrriq1Q0P5X1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Lrriq1Q0P5X1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
Lrriq1Q0P5X1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Lrriq1Q0P5X1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Lrriq1Q0P5X1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Lrriq1Q0P5X1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Lrriq1Q0P5X1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Lrriq1Q0P5X1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Lrriq1Q0P5X1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Lrriq1Q0P5X1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Lrriq1Q0P5X1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Lrriq1Q0P5X1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Lrriq1Q0P5X1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Lrriq1Q0P5X1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Lrriq1Q0P5X1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Lrriq1Q0P5X1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Lrriq1Q0P5X1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Lrriq1Q0P5X1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Lrriq1Q0P5X1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Lrriq1Q0P5X1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Lrriq1Q0P5X1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Lrriq1Q0P5X1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Lrriq1Q0P5X1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
Lrriq1Q0P5X1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Lrriq1Q0P5X1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Lrriq1Q0P5X1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
Lrriq1Q0P5X1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Lrriq1Q0P5X1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Lrriq1Q0P5X1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Lrriq1Q0P5X1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Lrriq1Q0P5X1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Lrriq1Q0P5X1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Lrriq1Q0P5X1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Lrriq1Q0P5X1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Lrriq1Q0P5X1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Lrriq1Q0P5X1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Lrriq1Q0P5X1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Lrriq1Q0P5X1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Lrriq1Q0P5X1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Lrriq1Q0P5X1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Lrriq1Q0P5X1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Lrriq1Q0P5X1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Lrriq1Q0P5X1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Lrriq1Q0P5X1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
Lrriq1Q0P5X1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Lrriq1Q0P5X1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Lrriq1Q0P5X1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
Lrriq1Q0P5X1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Lrriq1Q0P5X1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Lrriq1Q0P5X1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
Lrriq1Q0P5X1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Lrriq1Q0P5X1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Lrriq1Q0P5X1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Lrriq1Q0P5X1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Lrriq1Q0P5X1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Lrriq1Q0P5X1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Lrriq1Q0P5X1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Lrriq1Q0P5X1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Lrriq1Q0P5X1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Lrriq1Q0P5X1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Lrriq1Q0P5X1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Lrriq1Q0P5X1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Lrriq1Q0P5X1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Lrriq1Q0P5X1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Lrriq1Q0P5X1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Lrriq1Q0P5X1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Lrriq1Q0P5X1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Lrriq1Q0P5X1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Lrriq1Q0P5X1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Lrriq1Q0P5X1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms