Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r181Q0P547 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r181Q0P547 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vmn1r181Q0P547 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r181Q0P547 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r181Q0P547 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r181Q0P547 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r181Q0P547 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r181Q0P547 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vmn1r181Q0P547 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r181Q0P547 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r181Q0P547 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r181Q0P547 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r181Q0P547 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r181Q0P547 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r181Q0P547 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r181Q0P547 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vmn1r181Q0P547 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r181Q0P547 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r181Q0P547 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r181Q0P547 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vmn1r181Q0P547 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vmn1r181Q0P547 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms