Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Plac8l1Q08EJ0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Plac8l1Q08EJ0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Plac8l1Q08EJ0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Plac8l1Q08EJ0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms