Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sdr16c6Q05A13 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdr16c6Q05A13 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdr16c6Q05A13 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdr16c6Q05A13 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sdr16c6Q05A13 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdr16c6Q05A13 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sdr16c6Q05A13 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdr16c6Q05A13 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdr16c6Q05A13 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sdr16c6Q05A13 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sdr16c6Q05A13 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdr16c6Q05A13 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdr16c6Q05A13 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sdr16c6Q05A13 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sdr16c6Q05A13 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sdr16c6Q05A13 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sdr16c6Q05A13 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdr16c6Q05A13 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdr16c6Q05A13 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sdr16c6Q05A13 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms