Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Fmn1Q05860 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Fmn1Q05860 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Fmn1Q05860 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Fmn1Q05860 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Fmn1Q05860 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Fmn1Q05860 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Fmn1Q05860 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Fmn1Q05860 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Fmn1Q05860 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Fmn1Q05860 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Fmn1Q05860 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Fmn1Q05860 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Fmn1Q05860 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Fmn1Q05860 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
Fmn1Q05860 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Fmn1Q05860 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Fmn1Q05860 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Fmn1Q05860 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Fmn1Q05860 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
Fmn1Q05860 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
Fmn1Q05860 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
Fmn1Q05860 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Fmn1Q05860 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Fmn1Q05860 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Fmn1Q05860 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Fmn1Q05860 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Fmn1Q05860 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Fmn1Q05860 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Fmn1Q05860 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Fmn1Q05860 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Fmn1Q05860 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Fmn1Q05860 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Fmn1Q05860 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Fmn1Q05860 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Fmn1Q05860 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Fmn1Q05860 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Fmn1Q05860 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Fmn1Q05860 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Fmn1Q05860 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Fmn1Q05860 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Fmn1Q05860 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Fmn1Q05860 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Fmn1Q05860 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Fmn1Q05860 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Fmn1Q05860 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Fmn1Q05860 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Fmn1Q05860 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Fmn1Q05860 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Fmn1Q05860 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Fmn1Q05860 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Fmn1Q05860 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Fmn1Q05860 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Fmn1Q05860 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Fmn1Q05860 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Fmn1Q05860 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Fmn1Q05860 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Fmn1Q05860 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Fmn1Q05860 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Fmn1Q05860 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Fmn1Q05860 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Fmn1Q05860 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Fmn1Q05860 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Fmn1Q05860 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Fmn1Q05860 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Fmn1Q05860 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Fmn1Q05860 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Fmn1Q05860 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Fmn1Q05860 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Fmn1Q05860 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Fmn1Q05860 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Fmn1Q05860 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Fmn1Q05860 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Fmn1Q05860 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Fmn1Q05860 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Fmn1Q05860 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Fmn1Q05860 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Fmn1Q05860 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Fmn1Q05860 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Fmn1Q05860 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Fmn1Q05860 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Fmn1Q05860 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Fmn1Q05860 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Fmn1Q05860 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
Fmn1Q05860 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Fmn1Q05860 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Fmn1Q05860 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Fmn1Q05860 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Fmn1Q05860 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Fmn1Q05860 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Fmn1Q05860 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
Fmn1Q05860 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Fmn1Q05860 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Fmn1Q05860 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Fmn1Q05860 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Fmn1Q05860 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Fmn1Q05860 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Fmn1Q05860 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Fmn1Q05860 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Fmn1Q05860 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms