Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SryQ05738 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SryQ05738 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SryQ05738 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SryQ05738 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SryQ05738 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SryQ05738 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SryQ05738 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SryQ05738 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SryQ05738 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SryQ05738 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SryQ05738 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SryQ05738 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SryQ05738 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SryQ05738 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SryQ05738 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SryQ05738 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SryQ05738 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SryQ05738 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SryQ05738 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SryQ05738 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SryQ05738 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SryQ05738 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SryQ05738 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SryQ05738 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SryQ05738 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SryQ05738 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SryQ05738 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SryQ05738 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SryQ05738 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SryQ05738 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SryQ05738 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SryQ05738 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SryQ05738 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SryQ05738 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SryQ05738 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SryQ05738 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SryQ05738 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SryQ05738 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SryQ05738 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SryQ05738 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SryQ05738 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SryQ05738 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SryQ05738 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SryQ05738 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SryQ05738 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SryQ05738 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SryQ05738 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SryQ05738 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SryQ05738 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SryQ05738 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SryQ05738 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SryQ05738 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SryQ05738 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SryQ05738 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SryQ05738 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SryQ05738 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SryQ05738 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SryQ05738 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SryQ05738 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SryQ05738 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SryQ05738 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SryQ05738 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SryQ05738 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SryQ05738 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SryQ05738 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SryQ05738 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SryQ05738 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SryQ05738 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SryQ05738 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SryQ05738 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SryQ05738 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SryQ05738 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SryQ05738 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SryQ05738 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SryQ05738 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SryQ05738 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SryQ05738 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SryQ05738 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SryQ05738 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SryQ05738 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SryQ05738 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SryQ05738 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SryQ05738 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SryQ05738 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SryQ05738 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SryQ05738 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SryQ05738 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SryQ05738 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SryQ05738 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SryQ05738 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SryQ05738 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SryQ05738 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SryQ05738 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SryQ05738 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SryQ05738 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SryQ05738 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SryQ05738 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SryQ05738 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SryQ05738 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms