Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IhhP97812 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IhhP97812 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IhhP97812 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IhhP97812 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IhhP97812 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IhhP97812 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IhhP97812 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IhhP97812 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IhhP97812 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IhhP97812 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IhhP97812 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IhhP97812 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IhhP97812 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IhhP97812 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IhhP97812 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IhhP97812 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IhhP97812 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IhhP97812 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IhhP97812 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IhhP97812 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IhhP97812 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IhhP97812 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IhhP97812 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IhhP97812 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IhhP97812 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IhhP97812 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IhhP97812 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IhhP97812 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IhhP97812 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IhhP97812 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IhhP97812 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IhhP97812 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IhhP97812 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IhhP97812 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IhhP97812 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IhhP97812 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IhhP97812 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IhhP97812 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IhhP97812 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IhhP97812 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IhhP97812 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IhhP97812 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IhhP97812 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IhhP97812 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IhhP97812 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IhhP97812 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IhhP97812 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IhhP97812 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IhhP97812 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IhhP97812 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IhhP97812 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IhhP97812 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IhhP97812 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IhhP97812 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IhhP97812 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IhhP97812 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IhhP97812 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IhhP97812 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IhhP97812 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IhhP97812 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IhhP97812 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IhhP97812 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IhhP97812 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IhhP97812 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IhhP97812 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IhhP97812 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IhhP97812 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IhhP97812 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IhhP97812 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IhhP97812 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IhhP97812 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IhhP97812 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IhhP97812 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IhhP97812 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IhhP97812 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IhhP97812 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IhhP97812 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IhhP97812 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IhhP97812 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IhhP97812 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IhhP97812 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IhhP97812 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IhhP97812 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IhhP97812 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IhhP97812 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IhhP97812 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IhhP97812 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IhhP97812 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IhhP97812 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IhhP97812 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IhhP97812 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IhhP97812 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IhhP97812 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IhhP97812 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IhhP97812 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IhhP97812 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IhhP97812 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IhhP97812 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IhhP97812 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms