Protein–RNA interactions for Protein: P84084

Arf5, ADP-ribosylation factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf5P84084 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Arf5P84084 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arf5P84084 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arf5P84084 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Arf5P84084 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arf5P84084 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arf5P84084 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arf5P84084 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arf5P84084 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arf5P84084 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Arf5P84084 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arf5P84084 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arf5P84084 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arf5P84084 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arf5P84084 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arf5P84084 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arf5P84084 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arf5P84084 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arf5P84084 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Arf5P84084 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arf5P84084 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arf5P84084 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arf5P84084 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arf5P84084 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arf5P84084 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arf5P84084 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Arf5P84084 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arf5P84084 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arf5P84084 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arf5P84084 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arf5P84084 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arf5P84084 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arf5P84084 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arf5P84084 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arf5P84084 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arf5P84084 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arf5P84084 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arf5P84084 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arf5P84084 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Arf5P84084 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Arf5P84084 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arf5P84084 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arf5P84084 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arf5P84084 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arf5P84084 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arf5P84084 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arf5P84084 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Arf5P84084 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arf5P84084 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arf5P84084 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arf5P84084 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arf5P84084 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Arf5P84084 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Arf5P84084 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arf5P84084 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arf5P84084 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arf5P84084 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Arf5P84084 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Arf5P84084 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arf5P84084 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arf5P84084 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arf5P84084 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arf5P84084 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arf5P84084 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arf5P84084 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arf5P84084 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arf5P84084 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arf5P84084 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Arf5P84084 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arf5P84084 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arf5P84084 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arf5P84084 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arf5P84084 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arf5P84084 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arf5P84084 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arf5P84084 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms