Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casp4P70343 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casp4P70343 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp4P70343 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp4P70343 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp4P70343 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp4P70343 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp4P70343 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp4P70343 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp4P70343 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casp4P70343 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casp4P70343 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casp4P70343 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Casp4P70343 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Casp4P70343 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Casp4P70343 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp4P70343 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp4P70343 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp4P70343 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp4P70343 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp4P70343 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp4P70343 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp4P70343 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp4P70343 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp4P70343 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp4P70343 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp4P70343 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp4P70343 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp4P70343 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp4P70343 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp4P70343 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp4P70343 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp4P70343 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casp4P70343 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casp4P70343 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casp4P70343 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casp4P70343 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casp4P70343 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casp4P70343 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casp4P70343 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casp4P70343 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casp4P70343 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casp4P70343 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casp4P70343 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casp4P70343 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casp4P70343 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casp4P70343 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casp4P70343 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casp4P70343 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casp4P70343 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp4P70343 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp4P70343 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp4P70343 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp4P70343 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casp4P70343 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp4P70343 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casp4P70343 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casp4P70343 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Casp4P70343 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casp4P70343 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casp4P70343 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casp4P70343 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casp4P70343 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casp4P70343 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casp4P70343 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp4P70343 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp4P70343 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp4P70343 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casp4P70343 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casp4P70343 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp4P70343 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp4P70343 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp4P70343 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp4P70343 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casp4P70343 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms