Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Chl1P70232 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chl1P70232 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chl1P70232 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chl1P70232 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chl1P70232 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chl1P70232 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chl1P70232 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Chl1P70232 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Chl1P70232 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Chl1P70232 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Chl1P70232 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Chl1P70232 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Chl1P70232 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chl1P70232 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Chl1P70232 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chl1P70232 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chl1P70232 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chl1P70232 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Chl1P70232 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chl1P70232 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chl1P70232 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chl1P70232 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chl1P70232 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Chl1P70232 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Chl1P70232 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Chl1P70232 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chl1P70232 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chl1P70232 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Chl1P70232 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chl1P70232 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chl1P70232 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Chl1P70232 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Chl1P70232 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chl1P70232 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chl1P70232 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chl1P70232 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Chl1P70232 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chl1P70232 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Chl1P70232 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Chl1P70232 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Chl1P70232 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chl1P70232 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chl1P70232 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chl1P70232 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Chl1P70232 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chl1P70232 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chl1P70232 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chl1P70232 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Chl1P70232 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Chl1P70232 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Chl1P70232 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chl1P70232 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chl1P70232 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chl1P70232 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chl1P70232 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Chl1P70232 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chl1P70232 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chl1P70232 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chl1P70232 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chl1P70232 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Chl1P70232 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chl1P70232 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Chl1P70232 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chl1P70232 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chl1P70232 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Chl1P70232 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chl1P70232 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Chl1P70232 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chl1P70232 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Chl1P70232 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chl1P70232 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Chl1P70232 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chl1P70232 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Chl1P70232 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Chl1P70232 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms